يُعد برنامج بكالوريوس هندسة الميكاترونكس أحد البرامج الرئيسيّة التي يتم طرحها في قسم الهندسة الميكانيكيّة منذ عام 2009م، ويعد علم الميكاترونكس ميكانيكا إلكترونيّات هو تكامل الإلكترونيات وتكنولوجيا الكمبيوتر لنمذجة الأنظمة الميكانيكيّة والتحكم فيها، كما أنه ينطوي على تخصّصات عدّة مثل: الهندسة الكهربائيّة والميكانيكيّة والتحكم والكمبيوتر.وبما أن هندسة الميكاترونكس تمثل دمج التكنولوجيا الحديثة والتقنيات معاً لتأخذ دورها المهم في خدمة وتطوير الصناعة فهي تتلائم جيداً مع احتياجات سوق العمل المحليّة والإقليميّة والعالميّة.
يهدف برنامج هندسة الميكاترونكس إلى إعداد مهندسين على مستوى عالٍ من المهارات الهندسيّة والقدرة التنافسيّة القويّة لتلبية احتياجات السّوق المحلي والخارجي، كما يتم تشجيع الطلاب على المشاركة في البحث العلمي في مجال هندسة الميكاترونكس والتخصّصات ذات الصلة.
• المساهمة في تخريج مهندسي الميكاترونكس لتلبية متطلبات السّوق المحلّي والأجنبي.
• امتلاك مستوى واسع من المعرفة الضروريّة لفهم تأثير الحلول الهندسيّة على الصعيد العالمي والاقتصادي والبيئي والاجتماعي.
• تشجيع البحث العلمي والمعرفي في مجالات الهندسة المختلفة وخاصة المتعلقة بالميكاترونكس.
• توفير البيئة المناسبة لبناء علاقة تعاون وشراكة حقيقية بين الجامعة والمجتمع المحلي والفلسطيني الأوسع بحيث يكمل كل منهما الآخر.
• تطوير الكوادر العلمية والفنية لمواكبة التطور التكنولوجي، وتقديم تعليم عالٍ نوعي يربط المعلومات النظرية بتطبيقاتها الهندسية المعاصرة.
• التحكم في الآلات المحوسبة.
• أنظمة التحكم والحسّاسات.
• الأتمتة والروبوتات.
• تطوير التكنولوجيا الصناعيّة.
• تصميم وإنتاج الآلات الصناعيّة.
• التصميم باستخدام الحاسوب.
• المتحكمات الدقيقة والــــ “ PLC ” .
• المصانع: وتشمل الصّيانة، والتصميم، وصيانة وتصميم وإشراف خطوط الإنتاج وأنظمة التحكم.
• السيّارات وتشمل الصّيانة، وفحص المركبات وإدارة مبيعات.
• تصميم وصيانة الأنظمة الهيدروليكيّة مثل الشاحنات والجرافات.
• المصاعد الميكانيكيّة بكافّة أنواعها.
• المؤسّسات الحكوميّة.
• محطات توليد الطاقة: وتشمل طاقة الشمس، وطاقة الرياح، وطاقة الموائع وطاقة باطن الأرض.